Latviski English

Darbības pārskati

Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes atskaite par paraugu un ar tiem saistīto datu izmantošanu 2018. gadā.

Kategorija Saraksts
Pētījumi
  • ERAF Nr. 1.1.1.1/16/A/091  „ Metformīna terapijas ietekmējošo faktoru savstarpējās mijiedarbības izpēte 2.tipa cukura diabēta ārstēšanas efektivitātes prognozēšanai”. Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus faktorus, kas nosaka atbildes reakciju uz metformīna terapiju, nolūkā identificēt medikamenta efektivitāti un panesamību raksturojošus marķierus 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā. Projekta ietvaros tiek veikta veselu brīvprātīgo indivīdu asins paraugu transkriptoma sekvenēšana un iegūto sekvenēšanas datu analīze, lai identificētu metformīna ietekmē diferenciāli ekspresētus gēnus un ar tiem saistītos signālceļus.  
  • ERAF 1.1.1.1/16/A/066 "Molekulāro marķieru identificēšana hipofīzes adenomu veidošanās, attīstības gaitas un terapijas efektivitātes prognozēšanai", 2017. gada 1. janvāris - 2019. gada 31. decembris. Šī projekta galvenais mērķis ir izpētīt hipofīzes adenomu izveidošanos un progresēšanu nosakošos molekulāros marķierus un identificēt faktorus, kas nosaka klīniskā iznākuma mainību, un būtu pielietojami kā biomarķieri uzlabotai hipofīzes adenomas terapijai.

  • Melanomas metastāžu un sekundāro audzēju attīstības ģenētiskie marķieri (GENMEL); GENMEL Z/15/1285 - PRL15/15; 2015. gada 1. maijs – 2018. gada 31. oktobris. Projekta mērķis ir identificēt ģenētiskās izmaiņas, kuras varētu būt saistītas ar metastāžu un sekundāro audzēju veidošanos asimptomātiskos pacientos pēc primārās melanomas ķirurģiskas ārstēšanas, izmantojot progresīvas gēnu analīzes metodes. Projektā paredzēts, izmantojot eksomu sekvenēšanu un visa genoma retroelementu analīzi, noteikt ģenētiskās izmaiņas melanomas audos un asinīs pacientiem ar un bez metastāzēm, kā arī validēt atrastās izmaiņas pēc iespējas lielākā paraugu kopā, kā rezultātā tiks atrasti ģenētiskie marķieri, ar kuru palīdzību būs iespējams identificēt melanomas pacientus ar paaugstinātu metastāžu vai atkārtotas melanomas attīstības risku.

  • Jaunu luminiscentu savienojumu molekulārais dizains diagnostikas mērķiem; ERAF projekts Nr.211; 2017. gada 1.marts - 2020.gada 29. februāris. Projekta mērķis ir pārbaudīt dažādas jaunsintezētas fluorescentas krāsvielas diagnostikas nolūkos. Projektā paredzēts pārbaidīt fluorescento krāsvielu spektrālās īpašības tām saistoties ar plazmas albumīnu, kā arī piesaistoties pie šūnās membrānas normas un dažādu patoloģiju gadījumā.

  • VPP "Biomedicīna sabiedrības veselībai” (BIOMEDICINE), Projekts: Nr.2 „Diabēta un kardiovaskulāro komplikāciju molekulārie mehānismi, farmakoģenētika un jauni ārstniecības līdzekļi”, apakšprojekts 2.8. Projekta mērķis: Attīstīt zinātnisko kompetenci sabiedrības veselības nozarē, veicot iedzīvotāju veselības paradumu, klīniskos un biomedicīnas pētījumus, kā arī izstrādāt jaunus diagnostikas un ārstniecības līdzekļus un metodes, lai panāktu uzlabojumus diabēta komplikāciju ārstēšanā un profilaksē, kas nodrošinātu sabiedrības veselības stāvokļa uzlabošanos, tai skaitā mazinātu saslimstību un mirstību.

  • 1.1.1.1/16/A/016 SAM projekts: "Ar proteasomām saistīto multiplās sklerozes ģenētisko, epiģenētisko un klīnisko marķieru noteikšana". Projekta mērķis ir iegūt jaunas zināšanas par ģenētisko, genomisko un klīnisko proteasomu nozīmi MS patoģenēzē un gūt zināšanas un prasmes medicīniskam un farmakogenomiskam pielietojumam (2017. - 2020.). Plānotie rezultāti: jaunas zināšanas par proteasomu ģenētisko, genomisko un klīnisko nozīmi MS patoģenēzē un atbildes reakcijā uz ārstēšanu, jaunu ar proteasomām saistītu ģenētisku, epiģenētisku un klīnisku MS marķieru izveide, ko potenciāli varētu izmantot MS riska, prognozes un terapijas efektivitātes novērtēšanā, kā arī iegūtas zināšanas un prasmes tālākam medicīniskam un farmakogenomiskam pielietojumam personalizētās medicīnas attīstībā.

  • Unificēta terapeitiskā zāļu uzraudzības modeļa izveide pacientiem ar iekaisīgām zarnu slimībām (IZS), pielietojot imunoloģiskās, molekulārās bioloģijas un morfoloģijas metodes. Mērķis ir veikta tiopurīna metiltransferāzes polimorfismu noteikšana IZS pacientiem. Atbalsts no LU Fonda Mikrotīka stipendijas.

  • Pētījuma nosaukums "Klīniskais un imunoģenētiskais raksturojums pacientiem ar reimatisko drudzi Latvijā". Darba mērķis ir izpētīt reimatiskā drudža pacientu imunoģenētisko predispozīciju klīniski homogēnās grupās. Pētījumā iekļauti pacienti, kuri saslima ar reimatisko drudzi vecumā līdz 18 gadiem Latvijā no 1995. līdz 2016. gadam. Izpētītas RD epidemioloģiskās, klīniskās un laboratoriskās īpatnības, veikta DNS ekstrakcija un citokīnu gēnu (IL-10, IL-6) viena nukleotīda polimorfismu, TLR gēnu promoteru polimorfismu noteikšana un HLA II klases alēļu  genotipēšana RD pacientiem un kontroles grupai. HLA II klases alēļu  genotipēšana veikta ar Roshe akadēmijas finansiālo atbalstu.

  • Kristapa Lamstera pētniecības pieteikums Nr. 1.1.1.2/VIAA/1/16/118 , kas tiek finansēts no specifiskā atbalsta mērķa 1.1.1.2. pasākuma “Pēcdoktorantūras pētniecības atbalsts” ERAF projekta 1.1.1.2/16/I/001. Pētniecības projekta mērķis ir izpētīt zemledāja un ledāja malas veidojumus un procesus Skandināvijas ledusvairoga ārējās zonas dienvidu sektorā un mūsdienu ledājos Antarktikā, Grenlandē un Islandē. Ar VIGDB starpniecību veikta Islandes ezeru nogulumos sastopamo mikroorganismu identifikācija, izmantojot lielapjoma paralēlo sekvenēšanu.

  • Iedzimtu hiperholesterinēmiju izraisošo mutāciju noskaidrošana LDLR, APOB, PCSK9 un LDLRAP1 gēnos 21 hiperholesterinēmijas pacientam Latvijā. Izmantotie VIGDB resursi: gan DNS paraugi, gan lielapjoma paralēlā sekvencēšana.

  • Citi pētījumi: "Ar novecošanos saistītu molekulāro mehānismu izpēte labdabīgās prostatas hiperplāzijas attīstībā", "Ar novecošanos saistītu acu slimību ģenētisko faktoru izpēte", "Podagras ģenētiskie aspekti", "Reimatoīdā artrīta ģenētiskie apekti", "Neauglības ģenētiskie aspekti".

Publikācijas
  • Ozola A., Ruklisa D., Pjanova D. Association of the 16q24.3 region gene variants rs1805007 and rs4785763 with heightened risk of melanoma in Latvian population. Meta Gene (2018) 18:87-92.
  • Grasmane A., Rots D., Vitina Z, Magomedova V, Gailite L. The association of FMR1 gene (CGG)n variation with idiopathic female infertility.Archives of Medical Sciences (pieņemts publikācijai 2018,gadā, publicēšana 2019/2020 gadā).
  • Gailite, L., Rots, D., Pukite, I., Cernevska, G., Kreile, M. Case report: multiple UGT1A1 gene variants in a patient with Crigler-Najjar syndrome. BMC Pediatrics, Volume 18, Issue 1, 3 October 2018, 317. doi: 10.1186/s12887-018-1285-6.
  • Moisejevs G., Gailite L., Isajevs S., Nikitina Zake L., Kempa I., Janciauskis D., Kikuste I., Sivins A., Ancans G., Leja M. Lack of association between rs2067474 in the histamine receptor H2 gene and gastric cancer in Latvian population. Latvian Science Proceedings (pieņemts publicēšanai).
  • Elbere I, Silamikelis I, Ustinova M, Kalnina I, Zaharenko L, Peculis R, Konrade I, Ciuculete DM, Zhukovsky C, Gudra D, Radovica-Spalvina I, Fridmanis D, Pirags V, Schiöth HB, Klovins J 2018. Significantly altered peripheral blood cell DNA methylation profile as a result of immediate effect of metformin use in healthy individuals. Clinical Epigenetics DOI: 10.1186/s13148-018-0593-xiT scalled.
  • Ustinova M, Silamikelis I, Elbere I, Kalnina I, Ansone L, Rovite V, Radovica-Spalvina I, Fridmanis D, Aladyeva J, Konrade I, Pirags V, Klovins J. Metformin Strongly Affects Transcriptome of Peripheral Blood Cells in Healthy Individuals” (Iesniegta publicēšanai Scientific Reports).
  • Elbere I, Kalnina I, Silamikelis I, Konrade I, Zaharenko L, Sekace K, Radovica-Spalvina I, Fridmanis D, Gudra D, Pirags V, Klovins J. (2018) Association of metformin administration with gut microbiome dysbiosis in healthy volunteers. PLoS ONE 13(9): e0204317.
  • Tambets K, Yunusbayev B, Hudjashov G, Ilumäe AM, Rootsi S, Honkola T, Vesakoski O, Atkinson Q, Skoglund P, Kushniarevich A, Litvinov S, Reidla M, Metspalu E, Saag L, Rantanen T, Karmin M, Parik J, Zhadanov SI, Gubina M, Damba LD, Bermisheva M, Reisberg T, Dibirova K, Evseeva I, Nelis M, Klovins J, Metspalu A, Esko T, Balanovsky O, Balanovska E, Khusnutdinova EK, Osipova LP, Voevoda M, Villems R, Kivisild T, Metspalu M. Genes reveal traces of common recent demographic history for most of the Uralic-speaking populations. Genome Biol. 2018 Sep 21;19(1):139.
  • Ni G, Gratten J, Wray NR, Lee SH; Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium. Age at first birth in women is genetically associated with increased risk of schizophrenia. Sci Rep. 2018 Jul 5;8(1):10168.
  • Brainstorm Consortium; Analysis of shared heritability in common disorders of the brain. Science. 2018 Jun 22;360(6395).
  • Bipolar Disorder and Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium. Genomic Dissection of Bipolar Disorder and Schizophrenia, Including 28 Subphenotypes. Cell. 2018 Jun 14;173(7):1705-1715.
  • Ni G, Moser G; Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium, Wray NR, Lee SH. Estimation of Genetic Correlation via Linkage Disequilibrium Score Regression and Genomic Restricted Maximum Likelihood. Am J Hum Genet. 2018 Jun 7;102(6):1185-1194.
Konferenču tēzes
  • TPMT genotype polymorphism of selected IBD population in Latvia. WGO-GAT International Conference 2018, Bangkok, Thailand from 5th December to 8th December 2018. Authors: Polina Zalizko, Juris Stefanovics, Renars Erts, Vita Rovite, Janis Klovins, Aldis Pukitis.
  • Visnevska, V. Stanevica, V. Rovite, Z. Davidsone, A. Scegolevs, R. Shantere. Toll-like receptor 2 (TLR2) Arg753Gln and Toll-like receptor 4 (TLR4) Thr399Ile polymorphisms in children with rheumatic fever in Latvia - Proceedings of the 24th Paediatric Rheumatology European Society Congress: Part two Athens, Greece. 14-17 September 2017
  • Ozola A., Krūmiņa U., Verhovcova I., Pjanova D. Melanomas pacientu analīze Latvijā, izmantojot HaloPlexTM melanomas riska gēnu paneli un Ion TorrentTM sekvenēšanu. 76. Latvijas Universitātes konference, Molekulārās bioloģijas sesija. Rīga, Latvija, 02.02.2018. Mutiska prezentācija.

  • Ozola A., Verhovcova I., Pjanova D. Multiplex germline testing of melanoma cases in Latvia suspected to genetic predisposition. The 15th International Congress of the Society for Melanoma Research. October 24-27, 2018, Manchester, England. Abstract book, p 56. 

  • Pjanova D “Melanoma predisposition genetics and use of HaloPlex platform to assess mutations in high risk genes in Latvian population. XIV Baltic Congress of Laboratory Medicine, Viļņa, Lietuva, 10.05.-12.05.2018. Mutiska prezentācija.

  • Pjanova D, Leve I “ABM zondes spektrālās atšķirības normālos cilvēka fibroblastos un melanomas šūnās”, informatīvais seminārs par projektu „Jaunu luminiscentu savienojumu molekulārais dizains diagnostikas mērķiem”, Daugavpils, Latvija, 23.05.-25.05.2018.

  • Semanur Gündogdu, Ilze Birka, Valdis Pīrāgs, Linda Zaharenko, Ilze Elbere, Vita Rovīte, Jānis Kloviņš. CORRELATION OF FAECAL MICROBIOTA WITH LIVER STEATOSIS RISK FACTORS IN PATIENTS WITH NONINSULIN DEPENDENT DIABETES MELLITUS, Latvijas Universitātes starptautiskā zinātniskā konference 2018, Rīga, Latvija, International Scientific Conference on Medicine University of Latvia Riga, February 23, 2018, Book of Abstracts, p 56.

  • Nagle E., Rots D., Luksa N., Moisejevs G., Gailīte L. Why gout develops in some people but in others it does not? The VII Baltic Genetics Congress, 2018, Riga, Abstract book, p.232.

  • Grasmane A., Gailite L., Vitina Z., Magomedova V. IS IT NECESSARY TO ASSESS FMR1 GENE (CGG)N VARIATION IN FEMALE PATIENTS WITH IDIOPATHIC INFERTILITY? RSU International Students Scientific conference, 2018, Riga, Abstract book p., 82.

  • M .Ustinova, I. Silamiķelis, I. Elbere, I. Kalniņa, L. Zaharenko, R. Pečulis, I. Konrāde, V. Pīrāgs, J. Kloviņš. Metformin induces alterations in transcriptome profile of helathy individuals. Eiropas cilvēka ģenētikas asociācijas konference, Milāna, Itālija, 2018, stenda referāts.

  • M .Ustinova, I. Silamiķelis, I. Elbere, I. Kalniņa, L. Zaharenko, R. Pečulis, I. Konrāde, V. Pīrāgs, J. Kloviņš. Metformin-induced alterations in transcriptome profile of helathy individuals. Eiropas Diabēta pētniecības asociācijas konference, Berlīna, Vācija, 2018, stenda referāts.

  • Elbere, I. Kalnina, I. Silamikelis, I. I. Dindune, L. Gulbinska, L. Zaharenko, I. Radovica-Spalvina, D. Gudra, D. Fridmanis, I. Konrade, V. Pirags, J. Klovins. Metformin induced changes in gut microbiome composition in healthy individuals and newly-diagnosed type 2 diabetes patients. European Human Genetics Conference, Milan, Italy, 2018, abstract book.

  • Ilze I. Dindune, Ilze Elbere, Ineta Kalnina, Ivars Silamikelis, Ilze Konrade, Ilze Radovica-Spalvina, Dita Gudra, Valdis Pirags, Janis Klovins. The Effect of the Antidiabetic Drug Metformin on the Human Gut Microbiome’s Functional Profile. SymBioSE 2018 Croatia, abstract book.

  • Ilze I. Dindune, Ilze Elbere, Ineta Kalnina, Ivars Silamikelis, Ilze Konrade, Ilze Radovica-Spalvina, Dita Gudra, Valdis Pirags, Janis Klovins. The Imact on the Human Gut Microbiome’s Functional Profile Caused by the Antidiabetic Drug Metformin. 3rd European Summer School on Nutrigenomics, 2018. Jesi, Italy. Abstract published in Lifestyle Genomics 2018;11:19–38.

  • Ilze Elbere, Ineta Kalniņa, Ivars Silamiķelis, Liene Gulbinska, Ilze Konrāde, Linda Zaharenko, Ilze Radoviča-Spalviņa, Dāvids Fridmanis, Dita Gudrā, Valdis Pīrags, Jānis Kloviņš. Metformīna ierosinātas izmaiņas zarnu mikrobioma sastāvā veseliem indivīdiem un jaundiagnosticētiem 2.tipa cukura diabēta pacientiem. LU 76. Zinātniskā konference (Rīga, Latvija), 2018.

  • Pola Ļaksa, Kaspars Megnis, Vita Rovīte, Raitis Pečulis, Inga Balcere, Olīvija Caune, Andra Valtere, Ilze Konrāde, Jurijs Nazarovs, Austra Breikša, Jānis Stuķēns, Valdis Pīrāgs, Jānis Kloviņš, Tumor-specific cell-free DNA detection in blood plasma in patients with anterior pituitary adenoma, Eiropas bioloģijas studentu simpozijs “SymBioSE”, Zagreba, Horvātija.

  • Helvijs Niedra, Raitis Pečulis, Vita Rovīte, Jānis Kloviņš, Use of circulating cell-free DNA of human pituitary adenoma. The VII Baltic Genetics Congress – 2018, stenda referāts, Rīga.

  • Raitis Pečulis, Ilona Mandrika, Ramona Petrovska, Vita Rovīte, Olīvija Caune, Inga Balcere, Jānis Stuķēns, Ilze Konrāde, Valdis Pīrāgs, Jānis Kloviņš, Genome of cultured pituispheres represents genome of pituitary adenoma, The VII Baltic Genetics Congress – 2018, stenda referāts, Rīga.

  • Raitis Pečulis, Ilona Mandrika, Ramona Petrovska, Vita Rovīte, Olīvija Caune, Inga Balcere, Jānis Stuķēns, Ilze Konrāde, Valdis Pīrāgs, Jānis Kloviņš, Genome of pituispheres represents genome of pituitary adenoma, Genomic Medicine Cambridge 2018, conference book, stenda referāts, Kembridža.

  • MISDIAGNOSIS OF TYPE 2 DIABETES MELLITUS FOR PATIENTS WITH LATENT AUTOIMMUNE DIABETES IN ADULTS IN LATVIA. Jūlija Zavorikina , Vita Rovīte , Liene Ņikitina-Zaķe, Jānis Kloviņš. International scientific conference on medicine (23rd of February, 2018), University of Latvia.

  • Jekaterina Aladyeva "Integation of Online Analytical Processing system in biobank", European Biobank Week, Antwerp, Belgium, 4th-7th, September 2018.

  • Vita Rovīte "Latvian cohort of Type Two Diabetes patients - personalized medicine and improvement of health care system", European Biobank Week, Antwerp, Belgium, 4th-7th, September 2018.

  • Signe Mežinska "Linking biobanks with National Health Registries in Latvia: Policy, Chalanges and Solutions", European Biobank Week, Antwerp, Belgium, 4th-7th, September 2018.

Studiju darbi
  • Pētījums tiek veikts Rīgas Stradiņa universitātes doktorantūras nodaļas programmas “Medicīna” zinātniskā darba “Klīniskā norise un imunoģenētiskā predispozīcija pacientiem ar reimatisko drudzi Latvijā” ietvaros.
  • Studiju darbs, 6.kursa ārvalstu studente, Latvijas Universitātes Medicīnas fakultātes ārstniecības studiju programma, diplomdarbs ASSOCIATION OF FAECAL MICROBIOTA WITH LIVER STEATOSIS RISK FACTORS IN PATIENTS WITH NONINSULIN DEPENDENT DIABETES MELLITUS.
  • Rezidenta darbs, Latvijas Universitāte, Rezidentūras attīstības programma, Otrā tipa cukura diabēta riska alēļu ietekme uz sulfonilurīnvielas preparātu terapijas iznākumu OPTIMED pētījuma paraugkopā.
  • Promocijas darbs - RSU, Doktorantūras studiju nodaļa pirmais studiju gads, Promocijas darba tēma: ,,Klīniska hiperandrogēnisma izpausmes un cēloņi pusaudzēm’’.
  • Maģistra darba izstrāde - RSU Biomedicīnas studiju programma, pirmais studiju gads, tēma "Reimatoīdā artrīta ģenētiskie aspekti".
  • Maģistra darba izstrāde - RSU Biomedicīnas studiju programma, pirmais studiju gads, tēma, "ABCG2 gēna ģenētisko variantu nozīme podagras attīstībā".
  • Maģistra darbs (RSU Medicīnas fakultātes gala zinātniski pētnieciskais darbs), “FMR1 gēna analīze neauglīgām sievietēm".
  • Bakalaura programma, Latvijas Universitātes Bioloģijas fakultāte, kursa darbs "METFORMĪNA IEROSINĀTAS IZMAIŅAS GĒNU EKSPRESIJAS PROFILOS VESELĀS PERSONĀS".
  • Bakalaura programma, Latvijas Universitātes Bioloģijas fakultāte, kursa darbs "MIKROORGANISMU SABIEDRĪBU DAUDZVEIDĪBAS ANALĪZE MULAJEGIDLA IZVADLEDĀJA PIELEDĀJA EZERU NOGULUMOS".
  • LU BF studentes, bakalaura darbs “Taksonomiskās izmaiņas zarnu mikrobioma sastāvā, lietojot metformīnu, pacientiem ar 2.tipa cukura diabētu”.
  • LU BF studentes, bakalaura darbs “Antidiabētiskā medikamenta metformīna izraisītās funkcionālās izmaiņas cilvēka zarnu mikrobiomā”.
  • LU Bioloģijas fakultātes, bakalaura studiju programma, kursa darbs, "Audzēja specifiskās brīvi cirkulējošās DNS noteikšana adenohipofīzes adenomas pacientu asisns plazmā".
  • "Latvijas Universitāte, Bioloģijas fakultāte, doktora darbs (publikāciju kopa) “Jauni ģenētiskie riska faktori asociēti ar trīs multifaktoriālām pazīmēm un to īpašībām Latvijas populācijā”.
  • Bioloģijas bakalaura, Latvijas Universitāte, Bioloģijas fakultāte, HIPOFĪZES ADENOMU SOMATISKO MUTĀCIJU VALIDĒŠANA UN METODES IZSTRĀDE TO ATKLĀŠANAI CIRKULĒJOŠĀ BRĪVAJĀ DNS".
  • Bioloģijas bakalaura, Latvijas Universitāte, Bioloģijas fakultāte,  “Hipofīzes adenomu somatisko mutāciju noteikšana eksoma sekvencēšanas datos”.
Paraugu izsniegšana
  • DNS paraugi - 1436
  • Plazmas un seruma alikvotas - 390
Citas aktivitātes
  • Veikts BBMRI-ERIC kvalitātes novērtējums Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes kolekcijām un šī atbilstība atzīmēta starptautiskajā biobanku katalogā Directory.
  • Iekļaušanās MERIL Eiropas infastruktūru katalogā.
  • Balstoties uz VIGDB resursiem tiek veidoti jauni zinātnisko projektu pieteikumi.
  • Intervija Latvijas Avīzē (http://veselam.la.lv/2018/08/11/ka-jauna-zinatniece-ilze-elbere-grib-palidzet-diabeta-slimniekiem/).
  • Raksts žurnālā "Veselība" 2018. gada septembrī par ģenētisko datu drošību.
  • Dalība festivālā "Lampa" ar diskusiju "Biobanka - kāpēc piedalīties?".
  • Sižets raidījumā Izziņas Impulss (https://ltv.lsm.lv/lv/raksts/07.11.2018-izzinas-impulss-15.-serija.id143556/)
  • Skolēnu ekskursijas Valsts iedzīvotāju genoma datubāzē, Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centra ekskursiju ietvaros.
  • Eiropas Zinātnieku nakts 2018 aktivitāte "Ģenētiskais mantojums" Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā.
  • UNESCO Latvijas Nacionālā komisijas organizēts seminārs Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrā “Cilvēktiesību un bioētikas aspekti izglītībā. Kā meklēt un atrast atbildes uz bioētikas jautājumiem skolā?”, skolotājiem un skolu direktoriem.

Valsts iedzīvotāju genoma datubāzes atskaite par paraugu un ar tiem saistīto datu izmantošanu 2017. gadā.

Kategorija Saraksts
Pētījumi
  • Valsts pētījumu programma „Biomedicīna sabiedrības veselībai” (BIOMEDICINE) Apakšprojekta Nr.7.3. Projekta mērķis: Ar multidisciplināra konsorcija palīdzību pētīt vīrusu, baktēriju un makroorganisma mijiedarbību infekcijas procesa attīstības gaitā, šīs mijiedarbības mehānismus un determinantes inovatīvu infekcijas procesa regulācijas un modulācijas stratēģiju izveidei. Īstenošanas periods: 2014-2017.
  • Projekts "Melanomas metastāžu un sekundāro audzēju attīstības ģenētiskie marķieri (GENMEL)", kas tiek īstenots ERA-NET projekta TRANSCAN JTC2013 ietvaros. Projekta identifikācijas Nr.: GENMEL Z/15/1285 - PRL15/15. Izpildes termiņš: 1.05.2015.-30.04.2018. Dr.biol. Dace Pjanova. Projekta mērķis ir identificēt ģenētiskās izmaiņas, kuras varētu būt saistītas ar metastāžu un sekundāro audzēju veidošanos. Projekts “ Jaunu luminiscentu savienojumu molekulārais dizains diagnostikas mērķiem”, kas tiek veikts ERAF 1.1.1.1. pasākuma "Praktiskas ievirzes pētījumi" 1. kārtas ietvaros. Nr. 1.1.1.1/16/A/211. Izpildes termiņš: 1.03.2017.-29.02.2020. Projekta mērķis ir sintezēt jaunus luminoforus slimību diagnostikai medicīnā un veterinārmedicīnā.
  • Molekulāro marķieru identificēšana hipofīzes adenomu veidošanās, attīstības gaitas un terapijas efektivitātes prognozēšanai, atklāt prognostiskus un diagnostiskus HA molekulāros marķierus, ERAF, 1.1.1.1/16/A/066, 2017-2019.
  • Swedish Institute Grant Nr 19806/2016 “INNOVIMMUNE: Baltic platform for the innovative immunotherapies” 2016 - 2018.
  • MODY mutāciju skrīnings, kas ietver 13 riska gēnu kodējošo daļu analīzi, MODY ģenētisko riska faktoru raksturošanai Latvijas populācijā. Finansējuma avots ir VPP „Biomedicīna sabiedrības veselībai” (BIOMEDICINE) projekts Nr.2 „Diabēta un kardiovaskulāro komplikāciju molekulārie mehānismi, farmakoģenētika un jauni ārstniecības līdzekļi” apakšprojekts Nr.2.8., īstenošanas periods 2014-2017.
  • Sadarbībā ar VIGDB ir nodrošināta asins paraugu ievākšana un apstrāde (DNS izdalīšana un plazmas alikvotēšana, uzglabāšana) gēnu ekspresijas un epiģenētikas pētījumiem, kā arī fēču paraugu ievākšana zarnu mikrobioma pētījumiem ERAF projekta „Metformīna terapijas ietekmējošo faktoru savstarpējās mijiedarbības izpēte 2.tipa cukura diabēta ārstēšanas efektivitātes prognozēšanai” Nr.: 1.1.1.1/16/A/091 ietvaros. Projekta mērķis ir raksturot līdz šim maz pētītus faktorus, kas nosaka atbildes reakciju uz metformīna terapiju, nolūkā identificēt medikamenta efektivitāti un panesamību raksturojošus marķierus 2.tipa cukura diabēta (T2D) ārstēšanā. Tiek paredzēts, ka plānotās aktivitātes palīdzēs definēt zarnu mikrobioma lomu, atbildes reakcijas uz metformīna lietošanu regulācijā, kā arī sniegs ieskatu epiģenētisko marķieru profilos un to funkcionālajā nozīmē medikamenta terapijas kontekstā.
  • LatDiane: Latvijas diabētiskās nefropātijas pētījums; Mērķis - slāpekļa oksīda līmeņa noteikšana 1. tipa diabēta pacientu serumā/urīnā. Finansējums - LU snieguma/bāzes finansējums.
  • VIGDB izsniedz DNS paraugus lietošanai SAM projekta nr: 1.1.1.1/16/A/016 „Ar proteasomām saistīto multiplās sklerozes ģenētisko, epiģenētisko un klīnisko marķieru noteikšana” (vadītājs vai atbildīgā persona prof. Nikolajs Sjakste) ietvaros.
  • Plazmas membrānas Ca2+ ATFāzes 4 funkcionālās diagnostikas nozīme vīriešu neauglībā. PMCA4 gēna mutāciju ietekmes noteikšana uz spermatozoīdu kustīgumu un vīriešu auglības spēju. LZP grants No. 233/2012.
  • MYBPC1 gēna pētījums. Noskaidrot mutāciju biežumu M-motīva rajonā Latvijas kontroles un esenciālā tremora pacientu populācijās.
  • FKRP gēna pētījums. Noskaidrot mutācijas c.826C>A p.Leu276Ile biežumu Latvijas kontroles populācijā.
Publikācijas
  • McLaughlin RL, Schijven D, van Rheenen W, van Eijk KR, O'Brien M, Kahn RS, Ophoff RA, Goris A, Bradley DG, Al-Chalabi A, van den Berg LH, Luykx JJ, Hardiman O, Veldink JH; Project MinE GWAS Consortium; Schizophrenia Working Group of the Psychiatric Genomics Consortium. Genetic correlation between amyotrophic lateral sclerosis and schizophrenia. Nat Commun. 2017 Mar 21;8:14774.
  • Sviklāne L, Olmane E, Dzērve Z, Kupčs K, Pīrāgs V V, Sokolovska J. Fatty liver index and hepatic steatosis index predict non-alcoholic fatty liver disease in type 1 diabetes. J Gastroenterol Hepatol. 2017 May 2.
  • A New Baltic Population-Specific Human Genetic Marker in the PMCA4 Gene. Stavusis J, Inashkina I, Lace B, Pelnena D, Limborska S, Khrunin A, Kucinskas V, Krumina A, Piekuse L, Zorn B, Fodina V, Punab M, Erenpreiss J. Hum Hered. 2016;82(3-4):140-146. doi: 10.1159/000481434. Epub 2017 Nov 2.
  • Rovite V, Wolff-Sagi Y, Zaharenko L, Nikitina-Zake L, Grens E, Klovins J. Genome Database of the Latvian Population (LGDB): design, goals, and primary results. Journal of Epidemiology. Accepted August 6th, 2017, in press.
  • Ilze Elbere, Ineta Kalnina, Ivars Silamikelis, Ilze Konrade, Linda Zaharenko, Ilze Radovica-Spalvina, Davids Fridmanis, Dita Gudra, Valdis Pirags, Janis Klovins. Association of metformin administration with gut microbiome dysbiosis in healthy volunteers. The Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics.
Konferenču tēzes
  • A. Babre, E. Zole, V. Igumnova, I. Jansone, R.Ranka. Screening for mitochondrial DNA mutations C1494T and A1555G in tuberculosis patients in Latvia. Rīga Stradiņš University International student conference Health and social sciences, Riga, Latvia, 5 April 2017, Abstracts, p.104.
  • Zaiceva L., Jansons J., Dovbenko A., Petrovskis I., Skrastina D., Sominskaya I. “Detection of antibodies against HCV core and its alternative reading frame protein in patient serum” The international conference” Vaccines and Vaccination” Moscow, September 27-October 1, 2017, p.61.
  • Janis Klovins, Ilze Elbere, Raitis Peculis, Ineta Kalnina, Linda Zaharenko, Ilze Konrade & Valdis Pirags, Alterations in DNA methylation from peripheral blood cells in humans threated with metformin. 19th European Congress of Endocrinology, Lisbon, Portugal. Endocrine Abstracts (2017) 49 OC6.3.
  • Ilze Elbere, Ineta Kalnina, Ivars Silamikelis, Ilze Konrade, Linda Zaharenko, Ilze Radovica, Davids Fridmanis, Dita Gudra, Valdis Pirags, Janis Klovins. Changes induced by a weeklong metformin treatment in the human gut microbiome. AZ Nordic Baltic Diabetes Science Forum. Gothenburg, Sweden (2017).
  • Ilze Elbere, Ineta Kalnina, Ivars Silamikelis, Ilze Konrade, Linda Zaharenko, Ilze Radovica, Davids Fridmanis, Dita Gudra, Valdis Pirags, Janis Klovins. Association of metformin treatment with gut microbiome dysbiosis in healthy volunteers. 2nd annual Europan Microbiome Congress. London, UK (2017).
  • Nordic-Baltic Diabetes Science Forum, Translational and Clinical Metabolic Research, Gēteburgā, Zviedrijā, 19-20.01.2017. Sviklāne L., Olmane E., Dzērve Z., Kupčs K. and Sokolovska J. „A pilot study for validation of hepatic steatosis indices in patients with type 1 diabetes mellitus”.
  • ESHG European Human Genetics Conference 2017, Dānija, stenda ziņojums “A novel mutation in MYBPC1 is associated with myopathy, tremor, and spinal rigidity”. Janis Stavusis, Baiba Lace, Janelle Geist, Inna Inashkina, Dita Pelnena, Sander Pajusalu, Aikaterini Kontrogianni-Konstantopoulos, and Carsten G Bönnemann.
  • 14th Conference of the Baltic Child Neurology Association, Latvija, stenda ziņojums “Limb-Girdle Muscular Dystrophies - the current state in Latvia and Lithuania”. Janis Stavusis, Inna Inashkina, Dita Pelnena, Ieva Micule, Jurgis Strautmanis, Maruta S. Naudina, Loreta Cimbalistiene, Vaidutis Kucinskas, Astrida Krumina, Algirdas Utkus, Birute Burnyte, Ausra Matuleviciene, Baiba Lace.
  • LU 75. konference, molekulārās bioloģijas sekcija, Latvija, ziņojums “Jaunas MYBPC1 gēna mutācijas saistība ar iepriekš neaprakstītu miopātiju Latvijas ģimenē”. Jānis Stāvusis, Baiba Lāce, Janelle Geist, Inna Iņaškina, Dita Pelnēna, Sander Pajusalu, Aikaterini Kontrogianni-Konstantopoulos, and Carsten G Bönnemann.
Studiju darbi
  • Kursa darbs, Latvijas Universitāte, Bioloģijas fakultāte, Molekulārās bioloģijas katedra 1. kurss. Studiju darba nosaukums: PRETTUBERKULOZES ZĀĻU METABOLIZĒJOŠĀ ENZĪMA GSTM1 NULLES GENOTIPA IZPLATĪBA LATVIEŠU POPULĀCIJĀ.
  • Maģistra darbs, Rīgas Stradiņa universitāte, Farmācijas fakultāte Studiju darba nosaukums: SCREENING FOR MI TOCHONDRIAL DNA MUTATIONS C1494T AND A1555G IN TUBERCULOSIS PATIENTS IN LATVIA
  • Bakalaura darbs, LU BF, “Melanomas eksomu sekvenēšana ģenētisko marķieru identificēšanai”.
  • Bakalaura darbs, LU BF, “Ģenētiskās izmaiņas pārmantotās melanomas pacientiem Latvijā”.
  • Kursa darbs, Bioloģijas bakalaura 2. kurss, LU, Bioloģijas fak, HIPOFĪZES ADENOMU MUTĀCIJU SKRĪNINGS UN VALIDĀCIJA.
  • Kursa darbs "ANTI-ARFP ANTIVIELU KLĀTBŪTNES NOTEIKŠANA HCV PACIENTU SERUMĀ" LATVIJAS UNIVERSITĀTE BIOLOĢIJAS FAKULTĀTE MOLEKULĀRĀS BIOLOĢIJAS KATEDRA.
  • Kursa darbs, LU Bioloģijas fakultāte, "Antidiabētiskā medikamenta metformīna izraisītās funkcionālās izmaiņas cilvēka zarnu mikrobiomā".
  • Kursa darbs, LU Bioloģijas fakultāte, "Metformīna ietekme uz zarnu mikrobioma taksonomisko sastāvu pacientiem ar 2.tipa cukura diabētu".
  • Maģistra darbs, LU Bioloģijas fakultāte, "Ar metformīna lietošanu asociētas izmaiņas cilvēka zarnu mikrobioma sastāvā un DNS metilēšanas profilos".
  • Studiju darbs, profesionālā programma ārsta grāda iegūšanai; LU, Medicīnas fakultāte. SLĀPEKĻA OKSĪDA METABOLISMA ĪPATNĪBAS FIZISKI AKTĪVIEM 1. TIPA CUKURA DIABĒTA PACIENTIEM.
Paraugu izsniegšana
  • DNS paraugi - 3333
  • Seruma un plazmas alikvotas - 636
Citas aktivitātes
  • Izstrādāts Latvijas Biobanku likumprojekts.
  • Iegūta atļauja no Datu valsts inspekcijas (Nr. 006018) pacientu fiksēto medicīnisko datu izmantošanai pētījumos. Tiek veikts pilotpētījums otrā tipa diabēta ārstēšanas efektivitātes izvērtēšanai Latvijā.
  • Pētījumā iesaistītajiem pacientiem tiek gatavotas atbildes par atrasto ģenētisko variantu nozīmi viņu veselībai.
  • Tiek parakstīta BBMRI-ERIC partnerības harta.
  • Iekļaušanās BBMRI-ERIC biobanku katalogā Directory.